单位一般是不可以认定员工自动离职的，我国法律并没有自动离职的相关规定，劳动者离职一般需要提前通知用人单位。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条 劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。